Compte tenu des capacités d'accueil de 24 étudiants, l'inscription ne peut s'effectuer qu'après avis favorable du responsable de la préparation. Les étudiants intéressés doivent donc télécharger un dossier de candidature ou bien le demander au secrétariat de l'agrégation de Physique par courrier électronique avec pour sujet «demande de dossier» et en précisant dans le corps du message vos nom, prénom, université d'origine et adresse électronique permanente.
La rentrée de la préparation s'effectuant autour du 1er septembre, le dossier complété doit être retourné avant le 30 juin de l'année en cours (tout dossier parvenu après cette date sera examiné en liste complémentaire). Les candidats retenus sur liste principale seront avisés avant la fin de la première quinzaine de juillet et devront s'inscrire immédiatement auprès du service de la scolarité de l'Université Paul Sabatier. L'inscription au concours de l'agrégation est indispensable et indépendante de l'inscription à l'Université. Elle s'effectue directement sur le site web du ministère.